母巢之战游戏系统

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资源系统

与《星际争霸》原版相同，《母巢之战》游戏中的资源只有矿石（Mineral）和瓦斯（Gas）。其中矿石散落在地上，6至8块放在一起，一般一块的含量为1500单位，每块最多只能由1名采集者采集，不可两个或两个以上采集者同时采集。矿石收集完后会消失。瓦斯可在类似火山口处建提炼场后开采，一个气矿口的含量一般为5000单位。采集队伍每人带回来的量是8，而且这个值无法提升。瓦斯井枯竭后还可继续开采，产量减少为2。
基地可提供9至10个人员单位的消耗，其中特兰族为10，神族为9，虫族为1。特兰族要建供应站（Supply Depot）来维持其供给，而神族要建水晶能量塔（Pylon）来维持其精神力，虫族要生产领主（Overlord）来维持其控制力 [3] 。

建筑系统

《母巢之战》沿用了原作的全部建筑系统，具体如下：
人类
人族的建筑可以无限制建造，并且包括指挥中心在内的多种建筑都能起飞。人族建筑在遭到较严重的损伤之后会起火，起火期间建筑耐久会缓慢下降。SCV工程车可以维修受损的建筑。
除了常规建筑，人类的部分建筑还能添加附加建筑。附加建筑通常可以研究相应的功能，对单位进行强化。
异虫
虫族的所有建筑除孵化场和汲取器外，都需建在有机物上，有机物可来自虫族的孵化场或有机物蔓延（Creep Conoly）。每当生产一个建筑，有机物就会向周围扩展一定的范围。
星灵
神族的建筑要修在能量塔的附近。每座能量塔都能给一定范围内的建筑提供能量。这个范围在地图上表示就是一个圈，所有的建筑都要建在这个圈里，只有控制中心（Protoss Nexus）和Vespene Gas吸收室这两种开采矿物资源的建筑能够建在圆圈范围外。因此能量塔在神族里的地位很重要。另外每座能量塔还可分为8个神族部件的共同资源。如果一座能量塔被击毁，在其能量范围内的建筑就无法工作（如生产新的部队等） [3] 。

战役模式

与原作相同，《母巢之战》的战役也分为三个部分，对应三个种族。不过时间线顺序上有一定变更。虽然战役有时间线划分，但是并不需要玩家去解锁。玩家可以从任意一部分战役开始，并且自动保存已经通过的关卡进度。
三个战役分别如下：
第四章 神族战役：抵抗
第五章 人类战役：铁拳
第六章 虫族战役：刀锋女皇